1、存放于通风处：肉苁蓉可以在用塑料袋密封后，放置于干燥通风处，避免潮湿环境和阳光直射。如果肉苁蓉储存期间遇到潮湿或轻微虫害，应及时进行晾晒，再进行包装保存。
2、存放于冰箱内：肉苁蓉可以在蒸干后，放置在干燥环境中晾晒，并每天翻动，然后密封在塑料袋中以避免水蒸气。最后将肉苁蓉放入一个玻璃罐里密封，在冰箱中进行冷藏。
3、如果肉苁蓉保存不当出现发霉，应避免食用，否则可能会损害肝脏、肠胃等部位。
